İlçe merkezi çok eski bir yerleşim yeri olmasına rağmen şimdiki yerine 1700 lü yıllarda yerleştiği bilinmektedir. Bu tarihlerde adını aldığı şehrin kuzey batısındaki tepenin çevresinde toplanan köyler Boztepe'yi oluşturmuştur. Bu köyler Çanakçı, Kızmelik, Dağmezarı, Köçekli, Özlü Eski Boztepe ve Cevizbağıdır. Bundan sonra sürekli olarak büyüyen Boztepe 1938 depreminde oldukça büyük zarar görmüş, gelişmesi bir süre duraklamıştır. 1950 li yıllarda yeniden gelişmeye başlayan Boztepe 1960 yılında belediyenin kurulmasıyla kasaba olmuştur.

Belediye kurulduktan sonra sürekli gelişen ve şehirleşen Boztepe 09.05.1990 tarihinde kabul edilip 30.05.1990 tarihinde yürürlüğe giren 3644 Sayılı 130 İlçe kurulması hakkındaki kanun ile İlçe olmuştur. Bir Kasaba ile 13 köyü bünyesine alarak 2 Eylül 1991 tarihinde fiilen faaliyete geçmiştir.

İlin kuzeydoğusunda yer alan ilçemizin yüzölçümü 631 km2 olup,topraklarının çoğu Malya Ovası üzerinde yer almaktadır.Kalan kısmı ise yüksekliği fazla olmayan engebeli bir arazi üzerindedir. İlçe merkezinin denizden yüksekliği 1100 m.dir.

İlçemizin doğusunda Nevşehir'in Kozaklı ilçesi, batısında Kırşehir ili, kuzeyinde Çiçekdağı ilçesi güneyi ise Mucur ilçesi ile çevrilidir. İlçe İç Anadolu bölgesinin tipik karasal iklimine sahiptir.

Malya Tarım İşletme Müdürlüğü ilçemiz içinde kurulmuştur: 400 km2 yüzölçümlü Malya Ovası ilimizin verimli arazilerine sahiptir. Hem tarım hem de hayvancılık yapılmaktadır. Küçük sanayi sitesi kurulmuş bulunan ilçemiz hızla gelişmektedir. İlçemize bağlı Karacaören kasabasında belediye örgütü vardır. Kasabamızın nüfusu 1755 tir.